In Machinarium ci sono 12 trofei di cui 7 di bronzo, 4 di argento e 1 d’oro:
TROFEI DI BRONZO
Video game
Vinci tutti i giochi
Sopravvissuto
Fuggi dallo sfasciacarrozze
Accalappiacani
Porta il cane dalla signora
Amante della musica
Aiuta i musicisti
Prigione
Parcheggio gratis per i compagni di carcere
Maestro del gioco da tavolo
Vinci al gioco Tic-tac-toe
Ritorno in città
Entra a Machinarium
TROFEI DI ARGENTO
Soccorritore
Soccorri la ragazza
Idraulico
Copri i Blackhats
Mettere a punto
Ripara il cervello
Disattivatore
Disabilita la bomba
TROFEO D’ORO
Fuggitivo
Fuggi da Machinarium